无害化处理的产品不论是用于反刍动物，家禽，猪，宠物或者水产养殖，还用于工业的脂肪酸类，无害化处理操作和执行方法都会影响制作成本，销售品质和财务信用。这篇文章包括了系统说明，每个系统简要的操作描述，以及现在和未来要面对的挑战。而且还描述了系统的管理过程和满足监管要求的系统，比如ISO或者HACCP系统的认证。
首先，能源的消耗，处理方式，质量和过程的把控以及最终生成的产品，都主要取决于原材料本身和进入到各自加工系统的条件。尽管现在仍不可能实现“在母猪的耳朵里制作丝绸钱包”，但是选择特定的系统和操作可以从规定的原材料中得到质量最高的副产品，相反的，任何维护和不良操作的系统，哪怕是质量最高，最新鲜的原材料都会毁掉。
这些年来，采用各种技术来更改成品的质量，各种漂白技术，抗氧化剂，添加剂，有时还有掺假剂可以促进化学检测方法，用于对成品进行分类，从而使成品的质量比其他方式更高，价格规模也更高，所以，为了实现经济利润的最大化，最基本的需求就是要完全了解每一个原材料，处理系统，操作流程以及对质量的把控，同时也要完全符合法规的要求。
湿法无害化处理系统在产品制作工艺过程中会留下大量水分，或者如果它是存在干燥的。目前，它最常用于食用油脂的无害化处理以及部分脱脂牛肉丁和冷冻牛肉或其他产品的生产，而最早的工艺就是用木头或者煤块把水烧开，然后油脂浮到水壶最上面脱脂后再被使用，这种小规模方式的无害化处理也是非常普遍的。
干法无害化处理的初始阶段是有或者没有加压灭菌系统的，一直延续到现在是非常常见的系统，在二十世纪中期，干法无害化处理的批次化制罐开始普遍使用，最开始时，在使用适当的破碎或是预碎之前，将大型动物或者动物内脏在进行干燥前在批次化制罐中加压，和高压锅的效果一样使得骨头在加压的影响下变得更脆，更软以及更易处理，粒径减小技术消除了对利用压力减小尺寸的需求。然而，这种加压系统在欧洲需要重新调节，由于其他因素的减小对牛海绵状脑病的可控方案，它在北美洲将不再被次使用，而另一个可控方案已被采用于控制BSE。
